索马里历经连年战乱，总体安全形势严峻。极端反政府武装在首都摩加迪沙频繁发动汽车炸弹爆炸、迫击炮袭击、暗杀等暴力活动并造成严重人员伤亡。在索中、南部的加尔穆杜格州、希尔谢贝利州、西南州、朱巴兰州，暴力袭击事件亦时有发生，索国民军和非盟驻索特派团部队与索极端反政府武装之间的交战仍在持续。北部索马里兰州和邦特兰州安全形势相对较好，但极端反政府武装仍盘踞邦特兰州部分地区并不时发动暴力袭击，上述两州经常在大片争议地区发生纠纷甚至武装对峙，造成人员伤亡。

索大部分地区属热带沙漠气候，西南部属热带草原气候，终年高温，干燥少雨。主要自然灾害为旱灾、洪灾和沙尘暴。2010年至2012年发生严重旱灾，造成人道主义灾难，约26万人饿死。2016年至2017年再次发生旱灾，550万人受灾。