苏丹全国共有20多个机场，国内航线不多，在主要城市均设有机场，可供中小型客运和货运飞机起降，这些国内航线主要由国内航空公司运营。其中8个国际机场，仅喀土穆、苏丹港、尼亚拉等几个重要的城市的机场航班比较正常。

喀土穆国际机场是全国最大的机场，也是全境有固定国际航班的2个机场之一（另1个为苏丹港机场），设备相对先进、功能比较齐全。苏拥有7家国内航空公司，其中苏丹航空公司成立于1947年，是苏最大的航空公司。国际航班主要由国外航空公司包揽，主要国际航空公司有：埃及航空、阿联酋航空、卡塔尔航空、沙特航空、肯尼亚航空、埃塞航空、土耳其航空和阿联酋伊提哈德航空等。往返机场主要通过计程车和酒店接送服务。

外国人在苏丹多自驾车和搭乘出租车；出租车多为上世纪60、70年代的老旧车辆，一种轻便三轮摩托车较为受欢迎；国营公交系统运营主要路线，民营公交车无固定站牌和路线指示，一般招手即停，较适合熟悉当地情况的苏丹人。