贝宁全境属热带气候。南部为几内亚型气候，高温多雨，年最高气温39摄氏度，最低气温20度，年降雨量约1300毫米。

南部一年分为四季：11月至次年3月为大旱季，2-3月最热；4-7月为大雨季；7-9月为小旱季，气候宜人；9-10月为小雨季。

北部为苏丹型气候：昼夜温差大，年最低气温8度，最高气温42度，年降雨量约1000毫米。北部一年分两季：11月至次年5月为旱季，3-4月最热，6-10月为雨季。

贝宁每逢旱季的1、2月，经常刮来自撒哈拉沙漠的干热东北风，夹杂泥沙，亦称“哈马丹风”，对空气质量影响很大，对早播作物的产量亦有一定负面影响。

最佳旅行时间：春秋适宜