赤道几内亚属赤道多雨气候，潮湿，多雨多云，年平均气温24-26℃。大陆沿海地区年平均降雨量为2112.6毫米，年平均降雨天数152天，日最大降雨量144毫米，小时暴雨强度为23.5毫米；年气温变化在摄氏15度和32度之间；年平均相对湿度为88.8%；年平均日照5小时，一、二月份平均日照最长，在6小时以上；九、十月份平均日照最短，在4小时以内。

马拉博年降雨量约3100毫米；年气温变化在15-34摄氏度之间，平均气温25摄氏度；年平均相对湿度85%，三月份最低为约80%。