截至2012年，索马里全国有大小机场62座，其中仅有7座有铺面跑道。主要机场有：首都摩加迪沙亚丁·阿卜杜勒国际机场（Aden Abdulle International Airport），国际航班可达吉布提、伊斯坦布尔、内罗毕、亚的斯亚贝巴和迪拜，国内航班可达各主要城镇；索马里兰州首府哈尔格萨埃加勒国际机场（Egal International Airport），国际航班可达沙迦、迪拜、吉布提、亚的斯亚贝巴、内罗毕等地，国内航班可达主要城镇；邦特兰州博萨索班德·卡西姆国际机场（Bender Qassim International Airport）、索马里兰州柏培拉机场（Berbera Airport）、邦特兰州与加尔穆杜格州交界处加尔卡尤阿卜杜拉希·优素福机场（Abdullahi Yusuf Airport），分别有区域性国际航线与国内航线。

摩加迪沙城区街道布局较为整齐，路面硬化率较高，但破损严重。无公交系统，仅有私人运营的各式面包车载客，车况差，事故多发。

哈尔格萨市区路面硬化率为60%左右。因地处山谷地带，有较多的U形起伏路面。有公交系统，但都比较拥挤；出租车以两厢小车为主，车况和卫生条件一般。